1. 數碼電子陰道鏡診斷標準不一致。
盡管都根據病變的顏色、邊界與輪廓、血管或碘試驗（若采用REID評分法）進行診斷，鑒于檢查者對數碼電子陰道鏡所見圖像的解釋、判斷的標準不同及掌握的程度各異，因而評估的準確性差異很大，當然在很大程度上取決于檢查者的自身經驗和診斷水平。因此有可能漏掉病變或誤判為有病

2、數碼電子陰道鏡檢查指征把握不好。
檢查的指征為宮頸癌篩查試驗和/或臨床可疑病變均可轉至數碼電子陰道鏡檢查。但有些醫師在檢查前不做細胞學涂片，直接做鏡檢，或僅根據鏡檢所見加以處理，而對直接做宮頸活檢即可確診的明顯宮頸癌患者也做鏡檢，反映這些醫師并不明確鏡檢的指征是什么？不了解鏡檢的目的是什么。現今宮頸病變的診斷中鏡檢是繼細胞學初篩后的第二步檢查，檢查的目的是發現肉眼不能識別的癌前病變及無體征的早期宮頸癌，鏡下定位多點活檢，最后病理組織學檢查確診。

3、使用的數碼電子陰道鏡術語不統一。
目前有人還沿用1978年數碼電子陰道鏡術語及分類，如白斑基質、白斑鑲嵌等，文獻中白嵌、白嵌點，這種縮寫不恰當。名稱常與細胞學混淆如低度/高度宮頸鱗狀上皮內病變（LSIL/HSIL），檢查名稱宜與病理一致。術語統一便于國際、國內資料的可比性。

4、數碼電子陰道鏡檢查操作不規范，包括醋酸、碘溶液的配制不統一。
不少單位用2%或3%醋酸溶液，2%的碘溶液，更有甚者用碘酒或碘伏代替碘溶液。觀察時間短，涂上溶液后即做檢查，不了解鏡檢需動態觀察，醋酸反應有一定的時間，不僅影響觀察，且易漏診高度病變；鏡檢不按步驟操作，放大倍數過大，或開始即用綠色濾光等。

5、不了解或不重視數碼電子陰道鏡檢查的原理、基礎知識和基本技能。
對鱗柱交界（SCJ）、轉化區（TZ）和化生等概念不清；因此，不能識別SCJ和TZ，也就無法鑒別數碼電子陰道鏡檢查滿意和不滿意；又有人將醋白上皮（即用醋酸后宮頸呈不同程度的白色）視為病變，給予過度治療；有報道醋白上皮診斷宮頸病變的特異性僅為25%，薄層醋白上皮僅10%有異常病變。未成熟化生、炎癥、修復愈合與再生、HPV感染、濕疣、白斑及CIN和早期宮頸癌均可出現醋白反應，可見不是所有的醋白上皮都是病變，無醋白上皮的也未必沒有病變，應加以鑒別。